Nậm Củm bắt nguồn từ hợp lưu các suối ở vùng núi ở phần bắc xã Pa Ủ huyện Mường Tè tỉnh Lai Châu 22°41′16″B 102°40′39″Đ / 22,687763°B 102,677445°Đ / 22.687763; 102.677445 (Nậm Củm Pa Ủ). Đường biên giới Việt - Trung phần lớn đi theo đường phân thủy ở các núi này.

Nậm Củm chảy uốn lượn về hướng tây nam rồi nam, đổ vào Sông Đà ở bản Nậm Củm xã Mường Tè 22°28′49″B 102°36′46″Đ / 22,480367°B 102,612883°Đ / 22.480367; 102.612883 (Nậm Củm).

Cửa sông ở phía hạ lưu, từ Thủy điện Pắc Ma 22°33′58″B 102°31′4″Đ / 22,56611°B 102,51778°Đ / 22.56611; 102.51778 (Thủy điện Pắc Ma) chừng 18 km đường sông.